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La Atom 2.0 prevede la possibilità di sostituire il filamento durante la stampa, con ripresa automatica del lavoro in corso. Questa funzionalità è particolarmente utile sia per utilizzare sino in fondo le bobine, anche per lavori che richiedono una quantità di filamento maggiore di quella residua disponibile, sia per realizzare stampe in più colori. La procedura è particolarmente semplice, e può essere eseguita direttamente dal pannello di controllo in qualsiasi momento.